环状DNA甲基化测序
环状DNA甲基化测序
体液样品环状DNA测序
环状DNA的形成机理
目前研究表明，环状DNA是从染色体上断裂、环化或者额外复制产生的序列，其剪切加工机理主要提出有两种可能：（1）通过染色体异位同源重组环化（intrachromatid ectopic homologous recombination，HR）；（2）通过非同源染色体末端连接环化（nonhomologous end-joining，NHEJ）。环状DNA形成是一个复杂的过程，更多环化方式有待探索。
技术简介
针对血清、血浆、尿液、脑脊液等微量的体液样品，参考卢煜明教授团队开发的方法，酶切去除线性DNA后，利用Tn5转座酶，打开环状DNA环状结构并同时在DN**段两端加上接头，进行建库及测序。Tn5转座酶法效率高，损耗低，实现血液循环系统中微量的环状DNA的检测，双端测序，上机测序数据量24G。并且本产品能保留环状DNA的原始表达量，使得不同环状DNA间的表达量的比较更为准确。并通过严谨的环状DNA生信流程，实现了对环状DNA准确的识别和详细的基因注释。
技术优势
适用于微量体液样品：
此法减少DNA损失，并保留原始表达量，不同环状DNA间表达量比较更准确
专业的生物信息学分析：
专业的生物信息学团队，开发了高效识别分析环状DNA的算法，满足客户的各类深入数据分析需求。
一站式服务：
客户只需提供血清、血浆、尿液、脑脊液等体液，云序生物为您完成从样品准备、环状DNA富集、文库制备、上机测序到数据分析整套服务流程。
样本要求
样品类型：
血清、血浆、尿液、脑脊液。
样品量：
血清、血浆：5mL
尿液：5-10mL
脑脊液: 5mL
样品运输及保存：
样品干冰运输。血浆需使用EDTA抗凝管（紫色盖子抗凝管），勿用肝素管取样。
数据分析
1.环状DNA的识别及甲基化水平
2.环状DNA的基因注释
3.环状DNA长度分布图
4.环状DNA甲基化水平统计
案例解析
案例1：孕妇血浆中胎儿环状DNA 的特征是：呈甲基化状态以及被**
原文：Characteristics of Fetal Extrachromosomal Circular DNA in Maternal Plasma: Methylation Status and Clearance
期刊：Clinical Chemistry 影响因子：8.322
近期，NIPT之父卢煜明教授团队开发了一种环状DNA 甲基化分析的测序方案，通过对不同产后时间点的胎儿环状DNA含量的评估，研究了胎儿环状DNA的体外**效率。作者还发现血浆中的胎儿 环状DNA 与母体 环状DNA 相比甲基化程度相对较低。此外，和胎儿线性DNA类似，胎儿环状DNA在分娩后从母血中迅速**。总之，该团队基于转座酶和m5C位点酶学转化方法开发出了环状DNA甲基化测序技术，并揭示了孕妇血浆中的胎儿环状DNA甲基化状况，为环状DNA的深入研究及新型分子标志物的开发提供了新的技术手段。
